1、獨立式保護柱與分析柱連接時，連接管路盡可能短，且接口切面平滑，盡量減少死體積以降低柱外展寬效應。

    2、卡套式保護柱一般未標注液流方向，使用時自行標注，并按照標注方向來使用，以免正反向使用后，截留的雜質污染分析柱。

    3、直接填裝的短柱型保護柱，出現柱壓升高或峰型變差時，可不接分析柱進行反向清洗，清洗溶劑可參考分析柱清洗溶劑。

    4、卡套式保護柱，柱芯替換時，注意柱芯與柱套是否存在方向上的匹配，同時不易旋擰過緊，以防滑絲。

    5、保護柱或柱芯一般不建議超聲清洗，因可能對填料表面修飾有影響。

    6、如同一保護柱配不同的分析柱使用，每次使用前，保護柱需先清洗并用流動相平衡保護柱一段時間后，再接分析柱使用。

    保護柱與柱前自動低壓液相色譜的區別和使用：

    使用保護柱的目的在于延長分析柱的使用壽命，當分析柱造價昂貴時，保護柱的價值尤其能體現，某些情況下，當使用的分析柱本身價格便宜，保護柱并非必選，推薦使用柱前過濾器更合適。

    柱前過濾器與保護柱兩者外形相似，差異主要在于：保護柱內芯裝有填料，而柱前自動低壓液相色譜內芯是可更換的濾片（一般為帶孔的不銹鋼燒結板）

    因此，從結構可以推測使用上的差異：

    柱前自動低壓液相色譜——通用性強，任何分析柱前都可使用，因其濾芯只起到過濾和截留雜質的作用，濾片污染后可超聲清洗，反復使用。

    保護柱——柱中填料除了起截留雜質的作用外，也可除去樣品中易吸附的雜質，這一點對生物樣品分析尤其重要。